Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF3P61204 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF3P61204 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF3P61204 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF3P61204 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF3P61204 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF3P61204 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF3P61204 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF3P61204 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF3P61204 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF3P61204 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF3P61204 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF3P61204 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF3P61204 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF3P61204 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF3P61204 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF3P61204 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms