Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA9P57773 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA9P57773 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA9P57773 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA9P57773 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA9P57773 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA9P57773 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA9P57773 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA9P57773 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA9P57773 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA9P57773 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA9P57773 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA9P57773 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA9P57773 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA9P57773 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA9P57773 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA9P57773 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA9P57773 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA9P57773 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA9P57773 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA9P57773 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA9P57773 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA9P57773 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA9P57773 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA9P57773 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA9P57773 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA9P57773 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA9P57773 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA9P57773 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA9P57773 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GJA9P57773 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA9P57773 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA9P57773 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA9P57773 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA9P57773 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA9P57773 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA9P57773 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA9P57773 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA9P57773 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA9P57773 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA9P57773 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA9P57773 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA9P57773 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA9P57773 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA9P57773 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA9P57773 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA9P57773 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA9P57773 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA9P57773 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA9P57773 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA9P57773 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA9P57773 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA9P57773 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA9P57773 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA9P57773 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA9P57773 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA9P57773 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA9P57773 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA9P57773 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA9P57773 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA9P57773 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA9P57773 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA9P57773 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA9P57773 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA9P57773 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA9P57773 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA9P57773 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA9P57773 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA9P57773 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA9P57773 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA9P57773 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA9P57773 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA9P57773 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA9P57773 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA9P57773 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA9P57773 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA9P57773 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA9P57773 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA9P57773 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA9P57773 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA9P57773 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA9P57773 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA9P57773 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA9P57773 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA9P57773 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA9P57773 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA9P57773 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA9P57773 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms