Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms