Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms