Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RIPPLY3P57055 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms