Protein–RNA interactions for Protein: P56749

CLDN12, Claudin-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12P56749 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN12P56749 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms