Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms