Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms