Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVDP53602 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVDP53602 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVDP53602 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVDP53602 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVDP53602 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVDP53602 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVDP53602 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVDP53602 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MVDP53602 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MVDP53602 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVDP53602 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVDP53602 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVDP53602 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVDP53602 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVDP53602 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVDP53602 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVDP53602 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVDP53602 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVDP53602 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVDP53602 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVDP53602 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVDP53602 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVDP53602 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVDP53602 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVDP53602 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVDP53602 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms