Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A1P53007 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms