Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP5P51878 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP5P51878 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP5P51878 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP5P51878 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASP5P51878 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASP5P51878 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASP5P51878 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASP5P51878 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASP5P51878 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASP5P51878 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASP5P51878 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASP5P51878 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASP5P51878 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP5P51878 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP5P51878 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP5P51878 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP5P51878 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP5P51878 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP5P51878 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP5P51878 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP5P51878 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP5P51878 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP5P51878 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP5P51878 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP5P51878 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP5P51878 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CASP5P51878 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP5P51878 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CASP5P51878 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP5P51878 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP5P51878 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CASP5P51878 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP5P51878 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP5P51878 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP5P51878 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP5P51878 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP5P51878 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP5P51878 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP5P51878 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP5P51878 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP5P51878 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP5P51878 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP5P51878 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP5P51878 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP5P51878 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP5P51878 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP5P51878 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP5P51878 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP5P51878 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP5P51878 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP5P51878 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP5P51878 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP5P51878 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP5P51878 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP5P51878 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP5P51878 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP5P51878 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP5P51878 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP5P51878 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP5P51878 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP5P51878 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP5P51878 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP5P51878 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP5P51878 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP5P51878 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP5P51878 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP5P51878 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP5P51878 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP5P51878 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms