Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNQ1P51787 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNQ1P51787 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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