Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms