Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT4P50991 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT4P50991 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT4P50991 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT4P50991 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT4P50991 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT4P50991 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT4P50991 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT4P50991 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT4P50991 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT4P50991 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT4P50991 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT4P50991 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT4P50991 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT4P50991 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT4P50991 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT4P50991 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT4P50991 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT4P50991 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT4P50991 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT4P50991 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCT4P50991 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT4P50991 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT4P50991 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT4P50991 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT4P50991 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT4P50991 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT4P50991 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT4P50991 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT4P50991 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT4P50991 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT4P50991 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT4P50991 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT4P50991 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT4P50991 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT4P50991 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT4P50991 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT4P50991 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT4P50991 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT4P50991 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT4P50991 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT4P50991 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT4P50991 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT4P50991 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT4P50991 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT4P50991 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT4P50991 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT4P50991 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT4P50991 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT4P50991 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT4P50991 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT4P50991 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT4P50991 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT4P50991 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT4P50991 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT4P50991 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT4P50991 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT4P50991 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT4P50991 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT4P50991 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT4P50991 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT4P50991 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT4P50991 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT4P50991 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT4P50991 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT4P50991 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT4P50991 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT4P50991 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT4P50991 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT4P50991 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT4P50991 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT4P50991 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT4P50991 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT4P50991 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT4P50991 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT4P50991 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT4P50991 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT4P50991 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT4P50991 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT4P50991 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT4P50991 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT4P50991 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT4P50991 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT4P50991 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT4P50991 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT4P50991 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT4P50991 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT4P50991 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT4P50991 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT4P50991 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT4P50991 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT4P50991 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT4P50991 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT4P50991 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT4P50991 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT4P50991 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT4P50991 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT4P50991 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT4P50991 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT4P50991 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms