Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETV1P50549 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETV1P50549 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms