Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms