Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPAP49450 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPAP49450 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPAP49450 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPAP49450 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPAP49450 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPAP49450 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPAP49450 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPAP49450 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPAP49450 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPAP49450 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPAP49450 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPAP49450 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPAP49450 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPAP49450 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPAP49450 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPAP49450 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPAP49450 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPAP49450 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPAP49450 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPAP49450 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms