Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM4P49221 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM4P49221 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM4P49221 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms