Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NRIP1P48552 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP1P48552 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms