Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA8P48165 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA8P48165 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA8P48165 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA8P48165 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA8P48165 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA8P48165 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA8P48165 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA8P48165 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA8P48165 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA8P48165 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA8P48165 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA8P48165 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA8P48165 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA8P48165 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA8P48165 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA8P48165 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA8P48165 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA8P48165 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA8P48165 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA8P48165 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA8P48165 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA8P48165 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA8P48165 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA8P48165 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA8P48165 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA8P48165 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA8P48165 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA8P48165 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA8P48165 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA8P48165 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA8P48165 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA8P48165 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA8P48165 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA8P48165 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA8P48165 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA8P48165 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA8P48165 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA8P48165 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA8P48165 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA8P48165 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA8P48165 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA8P48165 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA8P48165 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA8P48165 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA8P48165 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA8P48165 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA8P48165 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA8P48165 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA8P48165 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA8P48165 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA8P48165 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA8P48165 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA8P48165 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA8P48165 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA8P48165 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA8P48165 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA8P48165 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA8P48165 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA8P48165 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA8P48165 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA8P48165 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA8P48165 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA8P48165 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA8P48165 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA8P48165 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA8P48165 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA8P48165 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA8P48165 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA8P48165 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA8P48165 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA8P48165 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA8P48165 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA8P48165 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA8P48165 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA8P48165 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA8P48165 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA8P48165 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA8P48165 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA8P48165 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA8P48165 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA8P48165 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA8P48165 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA8P48165 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA8P48165 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA8P48165 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA8P48165 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA8P48165 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA8P48165 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA8P48165 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA8P48165 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA8P48165 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA8P48165 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA8P48165 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA8P48165 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA8P48165 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA8P48165 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA8P48165 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA8P48165 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA8P48165 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms