Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPZBP47756 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms