Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RECQLP46063 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RECQLP46063 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RECQLP46063 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RECQLP46063 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RECQLP46063 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RECQLP46063 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RECQLP46063 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RECQLP46063 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RECQLP46063 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RECQLP46063 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RECQLP46063 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RECQLP46063 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RECQLP46063 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RECQLP46063 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RECQLP46063 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RECQLP46063 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RECQLP46063 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RECQLP46063 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RECQLP46063 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RECQLP46063 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RECQLP46063 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RECQLP46063 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RECQLP46063 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RECQLP46063 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RECQLP46063 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RECQLP46063 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RECQLP46063 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RECQLP46063 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RECQLP46063 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RECQLP46063 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RECQLP46063 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RECQLP46063 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RECQLP46063 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RECQLP46063 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RECQLP46063 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RECQLP46063 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RECQLP46063 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms