Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA4P43681 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms