Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD52P43351 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms