Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGCXP38435 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGCXP38435 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGCXP38435 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGCXP38435 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGCXP38435 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGCXP38435 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGCXP38435 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGCXP38435 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGCXP38435 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGCXP38435 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGCXP38435 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGCXP38435 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGCXP38435 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGCXP38435 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGCXP38435 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGCXP38435 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGCXP38435 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGCXP38435 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGCXP38435 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGCXP38435 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGCXP38435 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GGCXP38435 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGCXP38435 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GGCXP38435 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGCXP38435 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGCXP38435 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGCXP38435 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGCXP38435 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGCXP38435 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGCXP38435 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGCXP38435 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGCXP38435 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGCXP38435 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGCXP38435 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGCXP38435 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGCXP38435 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGCXP38435 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGCXP38435 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGCXP38435 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGCXP38435 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGCXP38435 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGCXP38435 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGCXP38435 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGCXP38435 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GGCXP38435 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGCXP38435 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGCXP38435 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGCXP38435 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GGCXP38435 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms