Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms