Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD34P28906 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD34P28906 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD34P28906 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD34P28906 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD34P28906 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD34P28906 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD34P28906 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD34P28906 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD34P28906 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD34P28906 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD34P28906 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD34P28906 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD34P28906 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms