Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms