Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms