Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms