Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC1P18754 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms