Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHCEP18577 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHCEP18577 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RHCEP18577 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHCEP18577 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHCEP18577 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHCEP18577 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHCEP18577 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHCEP18577 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHCEP18577 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHCEP18577 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHCEP18577 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHCEP18577 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHCEP18577 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHCEP18577 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHCEP18577 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHCEP18577 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHCEP18577 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHCEP18577 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHCEP18577 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHCEP18577 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHCEP18577 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHCEP18577 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHCEP18577 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHCEP18577 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHCEP18577 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHCEP18577 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHCEP18577 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHCEP18577 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHCEP18577 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHCEP18577 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHCEP18577 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHCEP18577 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHCEP18577 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHCEP18577 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHCEP18577 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHCEP18577 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHCEP18577 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHCEP18577 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHCEP18577 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHCEP18577 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RHCEP18577 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHCEP18577 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms