Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms