Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3L1P16619 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3L1P16619 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3L1P16619 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3L1P16619 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3L1P16619 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3L1P16619 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3L1P16619 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3L1P16619 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3L1P16619 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3L1P16619 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3L1P16619 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3L1P16619 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3L1P16619 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3L1P16619 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3L1P16619 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3L1P16619 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3L1P16619 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3L1P16619 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3L1P16619 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCL3L1P16619 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3L1P16619 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCL3L1P16619 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3L1P16619 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3L1P16619 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3L1P16619 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3L1P16619 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3L1P16619 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3L1P16619 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3L1P16619 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCL3L1P16619 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCL3L1P16619 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCL3L1P16619 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCL3L1P16619 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCL3L1P16619 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCL3L1P16619 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms