Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFAP15692 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms