Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL2P13500 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL2P13500 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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