Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms