Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHGAP10645 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHGAP10645 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHGAP10645 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHGAP10645 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHGAP10645 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHGAP10645 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHGAP10645 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CHGAP10645 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHGAP10645 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHGAP10645 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHGAP10645 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHGAP10645 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHGAP10645 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHGAP10645 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHGAP10645 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHGAP10645 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHGAP10645 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHGAP10645 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHGAP10645 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHGAP10645 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CHGAP10645 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHGAP10645 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHGAP10645 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHGAP10645 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHGAP10645 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHGAP10645 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHGAP10645 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHGAP10645 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHGAP10645 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHGAP10645 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHGAP10645 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHGAP10645 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHGAP10645 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHGAP10645 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHGAP10645 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHGAP10645 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CHGAP10645 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHGAP10645 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHGAP10645 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHGAP10645 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHGAP10645 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHGAP10645 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHGAP10645 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHGAP10645 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CHGAP10645 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHGAP10645 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHGAP10645 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHGAP10645 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHGAP10645 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHGAP10645 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHGAP10645 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHGAP10645 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHGAP10645 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHGAP10645 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHGAP10645 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHGAP10645 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHGAP10645 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHGAP10645 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHGAP10645 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHGAP10645 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHGAP10645 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHGAP10645 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHGAP10645 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHGAP10645 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHGAP10645 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHGAP10645 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHGAP10645 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CHGAP10645 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHGAP10645 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHGAP10645 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHGAP10645 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHGAP10645 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CHGAP10645 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHGAP10645 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHGAP10645 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHGAP10645 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHGAP10645 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHGAP10645 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHGAP10645 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHGAP10645 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHGAP10645 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHGAP10645 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHGAP10645 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHGAP10645 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHGAP10645 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHGAP10645 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHGAP10645 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHGAP10645 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHGAP10645 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHGAP10645 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHGAP10645 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHGAP10645 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHGAP10645 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHGAP10645 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHGAP10645 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CHGAP10645 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHGAP10645 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHGAP10645 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHGAP10645 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms