Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GLI3P10071 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GLI3P10071 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GLI3P10071 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GLI3P10071 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GLI3P10071 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GLI3P10071 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GLI3P10071 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GLI3P10071 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GLI3P10071 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GLI3P10071 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GLI3P10071 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GLI3P10071 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GLI3P10071 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GLI3P10071 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GLI3P10071 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GLI3P10071 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GLI3P10071 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GLI3P10071 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GLI3P10071 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GLI3P10071 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GLI3P10071 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GLI3P10071 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GLI3P10071 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GLI3P10071 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GLI3P10071 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GLI3P10071 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GLI3P10071 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
GLI3P10071 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
GLI3P10071 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GLI3P10071 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GLI3P10071 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GLI3P10071 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GLI3P10071 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GLI3P10071 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GLI3P10071 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GLI3P10071 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GLI3P10071 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GLI3P10071 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GLI3P10071 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GLI3P10071 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GLI3P10071 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GLI3P10071 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GLI3P10071 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GLI3P10071 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GLI3P10071 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GLI3P10071 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GLI3P10071 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GLI3P10071 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GLI3P10071 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GLI3P10071 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GLI3P10071 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GLI3P10071 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GLI3P10071 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GLI3P10071 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GLI3P10071 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GLI3P10071 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GLI3P10071 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GLI3P10071 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GLI3P10071 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GLI3P10071 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GLI3P10071 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GLI3P10071 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GLI3P10071 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GLI3P10071 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GLI3P10071 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GLI3P10071 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GLI3P10071 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GLI3P10071 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GLI3P10071 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GLI3P10071 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GLI3P10071 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GLI3P10071 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GLI3P10071 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GLI3P10071 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GLI3P10071 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GLI3P10071 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GLI3P10071 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GLI3P10071 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GLI3P10071 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GLI3P10071 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GLI3P10071 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GLI3P10071 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GLI3P10071 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GLI3P10071 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GLI3P10071 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GLI3P10071 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GLI3P10071 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GLI3P10071 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GLI3P10071 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GLI3P10071 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GLI3P10071 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GLI3P10071 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GLI3P10071 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GLI3P10071 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GLI3P10071 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GLI3P10071 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GLI3P10071 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GLI3P10071 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GLI3P10071 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms