Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms