Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms