Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPBP07199 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPBP07199 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPBP07199 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPBP07199 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPBP07199 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPBP07199 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPBP07199 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPBP07199 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPBP07199 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPBP07199 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPBP07199 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPBP07199 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPBP07199 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPBP07199 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPBP07199 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPBP07199 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPBP07199 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPBP07199 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPBP07199 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPBP07199 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPBP07199 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPBP07199 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPBP07199 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPBP07199 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPBP07199 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPBP07199 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPBP07199 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPBP07199 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPBP07199 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPBP07199 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPBP07199 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPBP07199 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPBP07199 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPBP07199 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPBP07199 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPBP07199 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPBP07199 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPBP07199 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPBP07199 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPBP07199 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPBP07199 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
CENPBP07199 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPBP07199 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPBP07199 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPBP07199 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPBP07199 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPBP07199 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPBP07199 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPBP07199 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPBP07199 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPBP07199 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPBP07199 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPBP07199 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPBP07199 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPBP07199 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPBP07199 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPBP07199 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPBP07199 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPBP07199 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPBP07199 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPBP07199 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPBP07199 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPBP07199 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPBP07199 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPBP07199 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPBP07199 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPBP07199 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPBP07199 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPBP07199 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPBP07199 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPBP07199 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPBP07199 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPBP07199 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPBP07199 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPBP07199 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPBP07199 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPBP07199 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPBP07199 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CENPBP07199 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPBP07199 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPBP07199 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPBP07199 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPBP07199 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPBP07199 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPBP07199 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPBP07199 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPBP07199 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPBP07199 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPBP07199 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPBP07199 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPBP07199 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPBP07199 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPBP07199 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPBP07199 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPBP07199 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPBP07199 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPBP07199 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPBP07199 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPBP07199 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms