Protein–RNA interactions for Protein: P06729

CD2, T-cell surface antigen CD2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2P06729 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD2P06729 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD2P06729 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD2P06729 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD2P06729 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD2P06729 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD2P06729 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD2P06729 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD2P06729 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD2P06729 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD2P06729 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD2P06729 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD2P06729 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD2P06729 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD2P06729 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD2P06729 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD2P06729 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD2P06729 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD2P06729 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD2P06729 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD2P06729 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD2P06729 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD2P06729 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD2P06729 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD2P06729 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms