Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA4P06727 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA4P06727 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA4P06727 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA4P06727 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA4P06727 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA4P06727 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA4P06727 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA4P06727 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA4P06727 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA4P06727 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA4P06727 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA4P06727 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA4P06727 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA4P06727 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA4P06727 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA4P06727 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA4P06727 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA4P06727 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA4P06727 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA4P06727 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA4P06727 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA4P06727 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA4P06727 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA4P06727 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA4P06727 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA4P06727 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA4P06727 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA4P06727 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA4P06727 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOA4P06727 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOA4P06727 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOA4P06727 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOA4P06727 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOA4P06727 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOA4P06727 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOA4P06727 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOA4P06727 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOA4P06727 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOA4P06727 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOA4P06727 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOA4P06727 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA4P06727 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA4P06727 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA4P06727 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA4P06727 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA4P06727 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA4P06727 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA4P06727 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA4P06727 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA4P06727 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA4P06727 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA4P06727 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA4P06727 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA4P06727 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA4P06727 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA4P06727 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA4P06727 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA4P06727 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA4P06727 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA4P06727 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA4P06727 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms