Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms