Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX7O95931 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX7O95931 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms