Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GMDSO60547 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GMDSO60547 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GMDSO60547 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GMDSO60547 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GMDSO60547 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GMDSO60547 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GMDSO60547 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GMDSO60547 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GMDSO60547 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GMDSO60547 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GMDSO60547 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GMDSO60547 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GMDSO60547 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GMDSO60547 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GMDSO60547 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GMDSO60547 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
GMDSO60547 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GMDSO60547 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms