Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms