Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF1O43189 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF1O43189 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF1O43189 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF1O43189 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF1O43189 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF1O43189 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF1O43189 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF1O43189 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF1O43189 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF1O43189 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF1O43189 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF1O43189 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF1O43189 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF1O43189 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF1O43189 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF1O43189 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF1O43189 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF1O43189 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF1O43189 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF1O43189 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF1O43189 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF1O43189 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF1O43189 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF1O43189 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF1O43189 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF1O43189 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF1O43189 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF1O43189 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF1O43189 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF1O43189 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF1O43189 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF1O43189 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF1O43189 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF1O43189 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF1O43189 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF1O43189 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF1O43189 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF1O43189 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF1O43189 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF1O43189 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF1O43189 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF1O43189 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF1O43189 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF1O43189 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF1O43189 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF1O43189 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF1O43189 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF1O43189 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF1O43189 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF1O43189 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF1O43189 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms