Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms